分子育種主要技術(shù)方法包括分子標(biāo)記輔助選擇（MAS）技術(shù)、全基因組選擇（GS）技術(shù)、轉(zhuǎn)基因技術(shù)、基因編輯技術(shù)等。分子育種是是指將分子生物學(xué)技術(shù)應(yīng)用于育種中，在分子水平上進(jìn)行育種。
　　我國政府十分重視分子育種技術(shù)發(fā)展，積極推動(dòng)分子育種產(chǎn)業(yè)化進(jìn)程。為服務(wù)國家戰(zhàn)略需要、培養(yǎng)國家戰(zhàn)略人才，根據(jù)教育部發(fā)布的2024年新專業(yè)目錄中，北京農(nóng)學(xué)院、大連海洋大學(xué)、新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)三所大學(xué)新增分子育種專業(yè)。在政策方面，分子育種相關(guān)政策有《種業(yè)振興行動(dòng)方案》、《關(guān)于扶持國家種業(yè)陣型企業(yè)發(fā)展的通知》、《國家種業(yè)創(chuàng)新發(fā)展規(guī)劃（2021-2035年）》等。
　　相比于傳統(tǒng)育種，分子育種具有育種周期短、變異范圍廣、差異性較小、均一性較好、操作簡便等優(yōu)勢。種子是農(nóng)業(yè)發(fā)展的基石，我國是全球主要育種需求國，分子育種產(chǎn)業(yè)發(fā)展空間廣闊。目前分子育種技術(shù)已在水產(chǎn)、畜禽、農(nóng)業(yè)等方面實(shí)現(xiàn)應(yīng)用，如水稻育種、小麥育種、棉花育種、轉(zhuǎn)基因大豆、基因編輯大豆、抗結(jié)核病牛、抗藍(lán)耳病豬。
　　在國際市場上，分子育種相關(guān)企業(yè)有拜耳、科迪華、英國Genus公司等。在國內(nèi)市場上，分子育種相關(guān)企業(yè)有華大智造、新銳恒豐、博瑞迪生物、格致博雅、極智生物、登海種業(yè)等。博瑞迪生物是一家專注于動(dòng)植物分子育種技術(shù)研發(fā)和應(yīng)用的企業(yè)，2020年-2023年2月，博瑞迪生物先后獲得5輪融資，在資本助力、技術(shù)賦能下，博瑞迪生物逐漸實(shí)現(xiàn)了從數(shù)據(jù)庫、算法、檢測試劑到國產(chǎn)化智能分子育種技術(shù)檢測平臺的零突破。
　　農(nóng)業(yè)生物育種，可分為1代農(nóng)家育種時(shí)代、2代雜交育種時(shí)代、3代分子育種時(shí)代、4代智能育種時(shí)代，目前部分發(fā)達(dá)國家已進(jìn)入“生物技術(shù)+人工智能+大數(shù)據(jù)信息技術(shù)”的4代智能育種時(shí)代，相比之下，我國還處于從2代雜交育種時(shí)代向3代分子育種時(shí)代邁進(jìn)的關(guān)鍵時(shí)期。
   我國基因編輯技術(shù)、分子標(biāo)記輔助選擇技術(shù)整體處于全球領(lǐng)先水平，因此分子育種技術(shù)與發(fā)達(dá)國家相差不大，但在技術(shù)成果轉(zhuǎn)化、實(shí)際應(yīng)用方面還存在較大差距。未來分子育種產(chǎn)業(yè)鏈上下游仍需進(jìn)一步聯(lián)動(dòng)，構(gòu)建完善的成果轉(zhuǎn)化體系和商業(yè)化運(yùn)營體系，推動(dòng)分子育種產(chǎn)業(yè)進(jìn)一步發(fā)展。